Protein–RNA interactions for Protein: O00198

HRK, Activator of apoptosis harakiri, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRKO00198 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HRKO00198 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HRKO00198 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HRKO00198 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HRKO00198 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HRKO00198 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HRKO00198 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HRKO00198 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HRKO00198 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HRKO00198 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HRKO00198 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HRKO00198 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HRKO00198 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HRKO00198 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HRKO00198 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HRKO00198 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HRKO00198 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HRKO00198 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HRKO00198 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HRKO00198 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
HRKO00198 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
HRKO00198 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HRKO00198 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HRKO00198 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HRKO00198 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
HRKO00198 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HRKO00198 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HRKO00198 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HRKO00198 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HRKO00198 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HRKO00198 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HRKO00198 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HRKO00198 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HRKO00198 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
HRKO00198 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HRKO00198 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HRKO00198 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HRKO00198 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HRKO00198 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HRKO00198 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HRKO00198 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HRKO00198 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HRKO00198 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HRKO00198 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HRKO00198 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HRKO00198 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HRKO00198 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HRKO00198 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HRKO00198 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HRKO00198 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HRKO00198 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HRKO00198 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HRKO00198 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HRKO00198 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
HRKO00198 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HRKO00198 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HRKO00198 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HRKO00198 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
HRKO00198 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HRKO00198 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HRKO00198 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HRKO00198 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HRKO00198 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HRKO00198 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HRKO00198 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HRKO00198 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HRKO00198 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HRKO00198 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HRKO00198 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HRKO00198 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HRKO00198 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HRKO00198 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HRKO00198 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HRKO00198 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HRKO00198 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HRKO00198 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HRKO00198 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HRKO00198 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HRKO00198 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HRKO00198 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HRKO00198 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HRKO00198 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HRKO00198 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HRKO00198 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HRKO00198 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HRKO00198 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HRKO00198 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HRKO00198 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HRKO00198 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HRKO00198 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HRKO00198 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HRKO00198 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HRKO00198 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HRKO00198 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HRKO00198 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HRKO00198 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
HRKO00198 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HRKO00198 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
HRKO00198 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HRKO00198 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms