Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC01387J3KSC0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC01387J3KSC0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC01387J3KSC0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC01387J3KSC0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC01387J3KSC0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC01387J3KSC0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC01387J3KSC0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC01387J3KSC0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC01387J3KSC0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC01387J3KSC0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC01387J3KSC0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC01387J3KSC0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC01387J3KSC0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC01387J3KSC0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC01387J3KSC0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC01387J3KSC0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC01387J3KSC0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC01387J3KSC0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC01387J3KSC0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC01387J3KSC0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC01387J3KSC0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC01387J3KSC0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC01387J3KSC0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC01387J3KSC0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC01387J3KSC0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC01387J3KSC0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC01387J3KSC0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC01387J3KSC0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC01387J3KSC0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC01387J3KSC0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC01387J3KSC0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC01387J3KSC0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC01387J3KSC0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC01387J3KSC0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC01387J3KSC0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC01387J3KSC0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC01387J3KSC0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC01387J3KSC0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC01387J3KSC0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC01387J3KSC0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC01387J3KSC0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC01387J3KSC0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC01387J3KSC0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC01387J3KSC0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC01387J3KSC0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC01387J3KSC0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms