Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms