Protein–RNA interactions for Protein: H3BU86

STX16-NPEPL1, STX16-NPEPL1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX16-NPEPL1H3BU86 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STX16-NPEPL1H3BU86 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STX16-NPEPL1H3BU86 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STX16-NPEPL1H3BU86 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STX16-NPEPL1H3BU86 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STX16-NPEPL1H3BU86 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STX16-NPEPL1H3BU86 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STX16-NPEPL1H3BU86 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STX16-NPEPL1H3BU86 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STX16-NPEPL1H3BU86 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STX16-NPEPL1H3BU86 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STX16-NPEPL1H3BU86 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STX16-NPEPL1H3BU86 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STX16-NPEPL1H3BU86 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STX16-NPEPL1H3BU86 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STX16-NPEPL1H3BU86 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STX16-NPEPL1H3BU86 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STX16-NPEPL1H3BU86 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STX16-NPEPL1H3BU86 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STX16-NPEPL1H3BU86 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
STX16-NPEPL1H3BU86 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STX16-NPEPL1H3BU86 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
STX16-NPEPL1H3BU86 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
STX16-NPEPL1H3BU86 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STX16-NPEPL1H3BU86 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STX16-NPEPL1H3BU86 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STX16-NPEPL1H3BU86 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STX16-NPEPL1H3BU86 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STX16-NPEPL1H3BU86 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STX16-NPEPL1H3BU86 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STX16-NPEPL1H3BU86 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STX16-NPEPL1H3BU86 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STX16-NPEPL1H3BU86 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STX16-NPEPL1H3BU86 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STX16-NPEPL1H3BU86 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STX16-NPEPL1H3BU86 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STX16-NPEPL1H3BU86 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STX16-NPEPL1H3BU86 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STX16-NPEPL1H3BU86 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STX16-NPEPL1H3BU86 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STX16-NPEPL1H3BU86 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STX16-NPEPL1H3BU86 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STX16-NPEPL1H3BU86 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STX16-NPEPL1H3BU86 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STX16-NPEPL1H3BU86 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STX16-NPEPL1H3BU86 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STX16-NPEPL1H3BU86 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STX16-NPEPL1H3BU86 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STX16-NPEPL1H3BU86 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STX16-NPEPL1H3BU86 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STX16-NPEPL1H3BU86 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STX16-NPEPL1H3BU86 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STX16-NPEPL1H3BU86 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STX16-NPEPL1H3BU86 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STX16-NPEPL1H3BU86 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STX16-NPEPL1H3BU86 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STX16-NPEPL1H3BU86 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
STX16-NPEPL1H3BU86 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms