Protein–RNA interactions for Protein: H3BRB1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BRB1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
H3BRB1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
H3BRB1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
H3BRB1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
H3BRB1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
H3BRB1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
H3BRB1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
H3BRB1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
H3BRB1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
H3BRB1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
H3BRB1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
H3BRB1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
H3BRB1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
H3BRB1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
H3BRB1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
H3BRB1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
H3BRB1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
H3BRB1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
H3BRB1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
H3BRB1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
H3BRB1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
H3BRB1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
H3BRB1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
H3BRB1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
H3BRB1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
H3BRB1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
H3BRB1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
H3BRB1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
H3BRB1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
H3BRB1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
H3BRB1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
H3BRB1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
H3BRB1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
H3BRB1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
H3BRB1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
H3BRB1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
H3BRB1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
H3BRB1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
H3BRB1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
H3BRB1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
H3BRB1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
H3BRB1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
H3BRB1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
H3BRB1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
H3BRB1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
H3BRB1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
H3BRB1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
H3BRB1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
H3BRB1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
H3BRB1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
H3BRB1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
H3BRB1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
H3BRB1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
H3BRB1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
H3BRB1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
H3BRB1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
H3BRB1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
H3BRB1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
H3BRB1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
H3BRB1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
H3BRB1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
H3BRB1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
H3BRB1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
H3BRB1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
H3BRB1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
H3BRB1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
H3BRB1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25■■□□□ 1.59
H3BRB1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
H3BRB1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
H3BRB1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25■■□□□ 1.59
H3BRB1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
H3BRB1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
H3BRB1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
H3BRB1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
H3BRB1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
H3BRB1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
H3BRB1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
H3BRB1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
H3BRB1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
H3BRB1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
H3BRB1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
H3BRB1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
H3BRB1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
H3BRB1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
H3BRB1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
H3BRB1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
H3BRB1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
H3BRB1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
H3BRB1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
H3BRB1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
H3BRB1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
H3BRB1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
H3BRB1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
H3BRB1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
H3BRB1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
H3BRB1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
H3BRB1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
H3BRB1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
H3BRB1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
H3BRB1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms