Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEDD8-MDP1E9PL57 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEDD8-MDP1E9PL57 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEDD8-MDP1E9PL57 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEDD8-MDP1E9PL57 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEDD8-MDP1E9PL57 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD8-MDP1E9PL57 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD8-MDP1E9PL57 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD8-MDP1E9PL57 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD8-MDP1E9PL57 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD8-MDP1E9PL57 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD8-MDP1E9PL57 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD8-MDP1E9PL57 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD8-MDP1E9PL57 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD8-MDP1E9PL57 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD8-MDP1E9PL57 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD8-MDP1E9PL57 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD8-MDP1E9PL57 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD8-MDP1E9PL57 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD8-MDP1E9PL57 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD8-MDP1E9PL57 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD8-MDP1E9PL57 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD8-MDP1E9PL57 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD8-MDP1E9PL57 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD8-MDP1E9PL57 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD8-MDP1E9PL57 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD8-MDP1E9PL57 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD8-MDP1E9PL57 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD8-MDP1E9PL57 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD8-MDP1E9PL57 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD8-MDP1E9PL57 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD8-MDP1E9PL57 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD8-MDP1E9PL57 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD8-MDP1E9PL57 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD8-MDP1E9PL57 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD8-MDP1E9PL57 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD8-MDP1E9PL57 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD8-MDP1E9PL57 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD8-MDP1E9PL57 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD8-MDP1E9PL57 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD8-MDP1E9PL57 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD8-MDP1E9PL57 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD8-MDP1E9PL57 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD8-MDP1E9PL57 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD8-MDP1E9PL57 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD8-MDP1E9PL57 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD8-MDP1E9PL57 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD8-MDP1E9PL57 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD8-MDP1E9PL57 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD8-MDP1E9PL57 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD8-MDP1E9PL57 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD8-MDP1E9PL57 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD8-MDP1E9PL57 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD8-MDP1E9PL57 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD8-MDP1E9PL57 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD8-MDP1E9PL57 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD8-MDP1E9PL57 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD8-MDP1E9PL57 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD8-MDP1E9PL57 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD8-MDP1E9PL57 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD8-MDP1E9PL57 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD8-MDP1E9PL57 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD8-MDP1E9PL57 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD8-MDP1E9PL57 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD8-MDP1E9PL57 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD8-MDP1E9PL57 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD8-MDP1E9PL57 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD8-MDP1E9PL57 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD8-MDP1E9PL57 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD8-MDP1E9PL57 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD8-MDP1E9PL57 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD8-MDP1E9PL57 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD8-MDP1E9PL57 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD8-MDP1E9PL57 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD8-MDP1E9PL57 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD8-MDP1E9PL57 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD8-MDP1E9PL57 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD8-MDP1E9PL57 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD8-MDP1E9PL57 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD8-MDP1E9PL57 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD8-MDP1E9PL57 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEDD8-MDP1E9PL57 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms