Protein–RNA interactions for Protein: A8MU46

SMTNL1, Smoothelin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNL1A8MU46 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMTNL1A8MU46 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMTNL1A8MU46 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMTNL1A8MU46 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMTNL1A8MU46 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMTNL1A8MU46 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMTNL1A8MU46 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMTNL1A8MU46 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMTNL1A8MU46 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMTNL1A8MU46 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMTNL1A8MU46 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SMTNL1A8MU46 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMTNL1A8MU46 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMTNL1A8MU46 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMTNL1A8MU46 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMTNL1A8MU46 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SMTNL1A8MU46 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SMTNL1A8MU46 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMTNL1A8MU46 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMTNL1A8MU46 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMTNL1A8MU46 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMTNL1A8MU46 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMTNL1A8MU46 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMTNL1A8MU46 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMTNL1A8MU46 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMTNL1A8MU46 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMTNL1A8MU46 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMTNL1A8MU46 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMTNL1A8MU46 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMTNL1A8MU46 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMTNL1A8MU46 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMTNL1A8MU46 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMTNL1A8MU46 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMTNL1A8MU46 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMTNL1A8MU46 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMTNL1A8MU46 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMTNL1A8MU46 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SMTNL1A8MU46 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMTNL1A8MU46 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMTNL1A8MU46 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMTNL1A8MU46 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMTNL1A8MU46 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMTNL1A8MU46 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMTNL1A8MU46 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMTNL1A8MU46 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMTNL1A8MU46 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMTNL1A8MU46 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMTNL1A8MU46 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMTNL1A8MU46 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMTNL1A8MU46 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMTNL1A8MU46 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMTNL1A8MU46 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMTNL1A8MU46 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMTNL1A8MU46 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMTNL1A8MU46 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMTNL1A8MU46 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMTNL1A8MU46 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMTNL1A8MU46 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMTNL1A8MU46 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMTNL1A8MU46 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMTNL1A8MU46 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMTNL1A8MU46 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMTNL1A8MU46 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMTNL1A8MU46 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SMTNL1A8MU46 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMTNL1A8MU46 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SMTNL1A8MU46 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMTNL1A8MU46 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMTNL1A8MU46 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SMTNL1A8MU46 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMTNL1A8MU46 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMTNL1A8MU46 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMTNL1A8MU46 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMTNL1A8MU46 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMTNL1A8MU46 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SMTNL1A8MU46 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMTNL1A8MU46 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMTNL1A8MU46 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMTNL1A8MU46 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMTNL1A8MU46 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMTNL1A8MU46 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMTNL1A8MU46 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMTNL1A8MU46 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMTNL1A8MU46 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMTNL1A8MU46 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMTNL1A8MU46 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMTNL1A8MU46 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMTNL1A8MU46 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMTNL1A8MU46 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMTNL1A8MU46 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMTNL1A8MU46 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMTNL1A8MU46 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMTNL1A8MU46 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMTNL1A8MU46 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMTNL1A8MU46 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMTNL1A8MU46 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SMTNL1A8MU46 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMTNL1A8MU46 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SMTNL1A8MU46 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SMTNL1A8MU46 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms