Protein–RNA interactions for Protein: A6NNZ2

Tubulin beta-8 chain-like protein LOC260334, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NNZ2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
A6NNZ2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A6NNZ2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A6NNZ2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A6NNZ2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
A6NNZ2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
A6NNZ2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A6NNZ2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
A6NNZ2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
A6NNZ2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A6NNZ2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
A6NNZ2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A6NNZ2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
A6NNZ2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
A6NNZ2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A6NNZ2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A6NNZ2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A6NNZ2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A6NNZ2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A6NNZ2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A6NNZ2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A6NNZ2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A6NNZ2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A6NNZ2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
A6NNZ2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
A6NNZ2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
A6NNZ2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A6NNZ2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A6NNZ2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
A6NNZ2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A6NNZ2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A6NNZ2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A6NNZ2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
A6NNZ2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
A6NNZ2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
A6NNZ2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
A6NNZ2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A6NNZ2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
A6NNZ2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A6NNZ2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A6NNZ2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A6NNZ2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A6NNZ2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A6NNZ2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A6NNZ2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A6NNZ2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A6NNZ2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A6NNZ2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A6NNZ2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A6NNZ2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A6NNZ2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A6NNZ2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A6NNZ2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A6NNZ2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A6NNZ2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A6NNZ2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A6NNZ2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A6NNZ2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A6NNZ2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A6NNZ2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A6NNZ2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A6NNZ2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A6NNZ2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A6NNZ2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A6NNZ2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A6NNZ2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A6NNZ2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A6NNZ2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A6NNZ2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A6NNZ2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A6NNZ2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A6NNZ2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A6NNZ2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
A6NNZ2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
A6NNZ2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
A6NNZ2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A6NNZ2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A6NNZ2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A6NNZ2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A6NNZ2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A6NNZ2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A6NNZ2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A6NNZ2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A6NNZ2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A6NNZ2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A6NNZ2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A6NNZ2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A6NNZ2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
A6NNZ2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A6NNZ2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A6NNZ2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A6NNZ2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A6NNZ2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A6NNZ2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A6NNZ2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A6NNZ2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A6NNZ2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A6NNZ2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A6NNZ2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A6NNZ2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms