Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TVP23AA6NH52 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TVP23AA6NH52 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms