Protein–RNA interactions for Protein: A6NFQ2

TCAF2, TRPM8 channel-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF2A6NFQ2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCAF2A6NFQ2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCAF2A6NFQ2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCAF2A6NFQ2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TCAF2A6NFQ2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCAF2A6NFQ2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCAF2A6NFQ2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCAF2A6NFQ2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCAF2A6NFQ2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCAF2A6NFQ2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCAF2A6NFQ2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCAF2A6NFQ2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCAF2A6NFQ2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCAF2A6NFQ2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TCAF2A6NFQ2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TCAF2A6NFQ2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TCAF2A6NFQ2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCAF2A6NFQ2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCAF2A6NFQ2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCAF2A6NFQ2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCAF2A6NFQ2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCAF2A6NFQ2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCAF2A6NFQ2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCAF2A6NFQ2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCAF2A6NFQ2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCAF2A6NFQ2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TCAF2A6NFQ2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TCAF2A6NFQ2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TCAF2A6NFQ2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TCAF2A6NFQ2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TCAF2A6NFQ2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCAF2A6NFQ2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCAF2A6NFQ2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCAF2A6NFQ2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TCAF2A6NFQ2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCAF2A6NFQ2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCAF2A6NFQ2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCAF2A6NFQ2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCAF2A6NFQ2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCAF2A6NFQ2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCAF2A6NFQ2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCAF2A6NFQ2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCAF2A6NFQ2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCAF2A6NFQ2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCAF2A6NFQ2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCAF2A6NFQ2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCAF2A6NFQ2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCAF2A6NFQ2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCAF2A6NFQ2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCAF2A6NFQ2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCAF2A6NFQ2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCAF2A6NFQ2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCAF2A6NFQ2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCAF2A6NFQ2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCAF2A6NFQ2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCAF2A6NFQ2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCAF2A6NFQ2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCAF2A6NFQ2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCAF2A6NFQ2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCAF2A6NFQ2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCAF2A6NFQ2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCAF2A6NFQ2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCAF2A6NFQ2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCAF2A6NFQ2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCAF2A6NFQ2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCAF2A6NFQ2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCAF2A6NFQ2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCAF2A6NFQ2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCAF2A6NFQ2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TCAF2A6NFQ2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCAF2A6NFQ2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCAF2A6NFQ2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCAF2A6NFQ2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCAF2A6NFQ2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCAF2A6NFQ2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TCAF2A6NFQ2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCAF2A6NFQ2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCAF2A6NFQ2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCAF2A6NFQ2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCAF2A6NFQ2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCAF2A6NFQ2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TCAF2A6NFQ2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCAF2A6NFQ2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCAF2A6NFQ2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCAF2A6NFQ2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCAF2A6NFQ2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCAF2A6NFQ2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCAF2A6NFQ2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCAF2A6NFQ2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCAF2A6NFQ2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCAF2A6NFQ2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCAF2A6NFQ2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCAF2A6NFQ2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCAF2A6NFQ2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCAF2A6NFQ2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCAF2A6NFQ2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCAF2A6NFQ2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TCAF2A6NFQ2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TCAF2A6NFQ2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TCAF2A6NFQ2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms