Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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