Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
A4GALTQ9NPC4 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms