Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT8

TUBGCP5, Gamma-tubulin complex component 5, humanhuman

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Length 1,024 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP5Q96RT8 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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TUBGCP5Q96RT8 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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TUBGCP5Q96RT8 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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TUBGCP5Q96RT8 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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TUBGCP5Q96RT8 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TUBGCP5Q96RT8 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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