Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 VDR-201ENST00000229022 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 TMEM168-201ENST00000312814 7470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 PRDM16-208ENST00000514189 4236 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 PPP1R12A-201ENST00000261207 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 NCBP1-202ENST00000375147 5178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 TTYH3-204ENST00000407643 4537 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 MYO7A-205ENST00000458637 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ATG16L2Q8NAA4 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms