Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 ZFYVE19-202ENST00000336455 1784 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 THPO-203ENST00000445696 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 RBM4-201ENST00000310092 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 KIR2DL3-201ENST00000342376 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 RBM25-204ENST00000526754 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 CHMP4C-201ENST00000297265 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms