Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC142Q17RM4 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms