Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AC073896.3-201ENST00000546789 437 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 DIO3OS-211ENST00000557532 712 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 AP003071.1-201ENST00000567925 622 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 ITGB2-AS1-204ENST00000609592 482 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 SFTPA2-205ENST00000640627 195 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 TTC23L-203ENST00000505624 1353 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 CASP2-203ENST00000392925 616 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 AC008440.1-201ENST00000455835 439 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 AC004969.1-201ENST00000471553 578 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 AC087072.1-201ENST00000603727 421 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 ZNF485-202ENST00000374435 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 GOSR2-209ENST00000575949 1444 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 RXRG-201ENST00000359842 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 UBIAD1-201ENST00000376804 825 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 GTF2I-203ENST00000443166 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 AC007679.1-201ENST00000458609 502 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 AL445363.2-201ENST00000554608 837 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 SHBG-217ENST00000576478 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 AC138150.1-201ENST00000589950 570 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 AC092327.2-201ENST00000595705 901 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 CLPP-205ENST00000596605 646 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 AC083798.2-202ENST00000609469 553 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 ZFAS1-208ENST00000618800 597 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 LINC01588-216ENST00000623502 975 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 AL445363.1-201ENST00000623749 952 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 TRAPPC4-214ENST00000533632 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 OSCP1-201ENST00000235532 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 OSCP1-203ENST00000356637 1463 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 XAGE2-201ENST00000286049 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 GYG2-201ENST00000353656 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 ASS1P1-201ENST00000402854 1237 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 SNORA50D-201ENST00000408059 134 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 AC007383.2-201ENST00000420509 752 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 KCNK15-AS1-202ENST00000427303 528 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 GHRL-206ENST00000430179 856 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 DMKN-211ENST00000436012 848 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 CIDEC-205ENST00000443115 443 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 RPL35P1-201ENST00000450819 370 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 LINC01875-201ENST00000454477 660 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 AL162377.1-202ENST00000456688 1181 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 TSTD1-206ENST00000466967 477 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 DTWD1-205ENST00000558653 1131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 AC099524.1-203ENST00000565272 756 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 AL080250.1-203ENST00000607799 747 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 AL450487.2-201ENST00000615934 407 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 AC139100.2-201ENST00000616901 662 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
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