Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 AL132656.4-201ENST00000623504 2122 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 TP53-201ENST00000269305 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 TP53-226ENST00000620739 2579 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 ERP29-201ENST00000261735 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 ARHGAP36-206ENST00000639280 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 AC068580.4-203ENST00000636397 4038 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 AC011899.1-201ENST00000436489 3600 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 NRIP2-201ENST00000337508 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 MKL1-212ENST00000618417 1842 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 FAM160A1-201ENST00000435205 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 PLA2G6-201ENST00000332509 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 RGL4-201ENST00000290691 2885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 BRD1-202ENST00000404034 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 LRSAM1-202ENST00000323301 3376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 BTNL3-201ENST00000342868 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 ITGB8-205ENST00000537992 3420 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 ZNF169-202ENST00000395395 1986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 POC5-213ENST00000514838 1984 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 SLC4A1AP-206ENST00000618046 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 NEK6-213ENST00000540326 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 SLC5A11-210ENST00000568579 2139 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 CEACAM19-201ENST00000358777 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 LINC02267-201ENST00000513393 1687 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 C12orf56-201ENST00000333722 3936 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 TYK2-202ENST00000524462 3456 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 SIN3A-208ENST00000567289 4078 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 CAPN9-201ENST00000271971 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 FBF1-212ENST00000636174 3626 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 ARMCX6-201ENST00000361910 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 RNF6-203ENST00000381588 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 ICOS-202ENST00000435193 2528 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 CNOT2-202ENST00000418359 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC9.71□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 MARCH5-201ENST00000358935 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 SETD7-201ENST00000274031 7365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 CTNNB1-203ENST00000396185 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 AC019294.1-202ENST00000566174 2071 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 ARHGEF9-221ENST00000635967 2179 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 MROH7-TTC4-201ENST00000414150 5867 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 CLNS1A-204ENST00000525428 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 RHBDL3-203ENST00000536287 4470 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 FAM131A-211ENST00000639617 4450 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 SLC35B4-201ENST00000378509 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 MORC2-AS1-201ENST00000422995 2274 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 RNF4-201ENST00000314289 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 GAL3ST4-203ENST00000413800 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 CEP83-201ENST00000339839 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 PTGER4P2-CDK2AP2P2-201ENST00000619442 3123 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 AL449403.1-201ENST00000432783 1577 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 RBM4-201ENST00000310092 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 ENPP5-201ENST00000230565 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 SNHG14-212ENST00000549804 7844 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 LINC01907-201ENST00000415174 2609 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 DCK-204ENST00000504952 2614 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
UBE2V1Q13404 MEGF8-203ENST00000378073 11034 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms