Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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FOXF1Q12946 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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FOXF1Q12946 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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FOXF1Q12946 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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FOXF1Q12946 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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