Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 TSPYL2-201ENST00000375442 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 ARL13B-201ENST00000303097 3264 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 AL590483.3-201ENST00000623669 3580 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 PNMA6F-201ENST00000436629 3348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 BAG6-235ENST00000362049 3626 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 NUMB-212ENST00000554546 3607 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 LDLRAD3-201ENST00000315571 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 SEC14L2-214ENST00000615189 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 MARK3-201ENST00000216288 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 SSR4P1-201ENST00000415143 412 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 LINC00563-201ENST00000566370 1400 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 RGL4-209ENST00000612432 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 KLF11-206ENST00000540845 3885 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 GK-203ENST00000378943 3707 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 NOL10-205ENST00000538384 3418 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 ETFDH-206ENST00000511912 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 YY1AP1-205ENST00000355499 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 PCBP1-AS1-227ENST00000435880 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 FANCC-202ENST00000375305 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 NLGN3-202ENST00000374051 3913 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 FDXACB1-201ENST00000260257 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 CHCHD7-201ENST00000303759 1684 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 LILRB1-202ENST00000396315 2157 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 AC106788.1-201ENST00000550753 2661 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 AXIN1-202ENST00000354866 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 HDLBP-204ENST00000391976 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 CDK16-201ENST00000276052 3016 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 CPNE4-201ENST00000429747 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 RFX5-215ENST00000452671 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 IGSF9-202ENST00000368094 4044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 ATL2-204ENST00000406122 2864 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 OPRK1-201ENST00000265572 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 CADM3-202ENST00000368125 3745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 FUT6-203ENST00000524754 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 NEK6-213ENST00000540326 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 MVK-213ENST00000625889 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 PRKAG2-202ENST00000392801 2281 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 TSEN2-204ENST00000415684 2279 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 HEXIM1-201ENST00000332499 3600 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 DDI1-201ENST00000302259 2609 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 SRRT-216ENST00000618262 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms