Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 SULT1A2-202ENST00000395630 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 B9D1-206ENST00000461069 923 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 RN7SL838P-201ENST00000481676 295 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 AC009120.2-205ENST00000561921 490 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 ABCC6P1-203ENST00000565566 1170 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 MIR4640-201ENST00000581824 90 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 CLPP-205ENST00000596605 646 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 BX322562.1-201ENST00000617004 561 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 AC006207.1-201ENST00000637958 562 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 TSTD1-206ENST00000466967 477 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 DLG4-206ENST00000485100 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 AC137579.2-201ENST00000517714 551 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAD3P84022 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms