Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 CYP4F11-201ENST00000248041 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 C1orf216-201ENST00000270815 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 PHB-215ENST00000617874 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 TUT1-202ENST00000308436 2826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 FAM95C-205ENST00000637556 2421 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 ESYT3-202ENST00000389567 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 WDR6-201ENST00000395474 4401 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 FAM177A1-201ENST00000280987 2927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 TNKS-213ENST00000522110 2900 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 WDR27-203ENST00000448612 3178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 GDPD5-202ENST00000443276 3106 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 RNF220-202ENST00000355387 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 SYK-204ENST00000375754 5005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 PCDHB2-201ENST00000194155 4126 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 TRIM21-201ENST00000254436 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 SLC26A6-203ENST00000358747 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 PRAMEF25-201ENST00000614839 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 PRAMEF26-201ENST00000624207 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 PSMC4-201ENST00000157812 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 LINC00442-202ENST00000456737 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 FMO1-203ENST00000402921 2003 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 EXOC7-207ENST00000411744 2031 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 CASC4-202ENST00000345795 3764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 GUCY1A3-205ENST00000506455 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 PLA2G4E-AS1-201ENST00000499478 2499 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 MAP1S-202ENST00000544059 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms