Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC3P51654 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC3P51654 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC3P51654 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GPC3P51654 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GPC3P51654 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GPC3P51654 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GPC3P51654 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GPC3P51654 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GPC3P51654 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GPC3P51654 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
GPC3P51654 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC3P51654 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC3P51654 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC3P51654 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC3P51654 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC3P51654 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC3P51654 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC3P51654 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC3P51654 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC3P51654 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC3P51654 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC3P51654 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC3P51654 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC3P51654 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC3P51654 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC3P51654 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC3P51654 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC3P51654 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC3P51654 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC3P51654 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC3P51654 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC3P51654 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC3P51654 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC3P51654 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC3P51654 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC3P51654 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC3P51654 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC3P51654 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC3P51654 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC3P51654 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC3P51654 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC3P51654 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC3P51654 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC3P51654 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC3P51654 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC3P51654 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPC3P51654 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC3P51654 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC3P51654 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC3P51654 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC3P51654 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC3P51654 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC3P51654 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC3P51654 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC3P51654 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC3P51654 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC3P51654 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC3P51654 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC3P51654 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC3P51654 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC3P51654 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC3P51654 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC3P51654 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC3P51654 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC3P51654 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC3P51654 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC3P51654 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC3P51654 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC3P51654 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC3P51654 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC3P51654 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC3P51654 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC3P51654 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC3P51654 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC3P51654 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC3P51654 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC3P51654 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC3P51654 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC3P51654 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC3P51654 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC3P51654 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC3P51654 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC3P51654 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC3P51654 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC3P51654 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC3P51654 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC3P51654 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC3P51654 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC3P51654 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC3P51654 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC3P51654 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GPC3P51654 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC3P51654 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC3P51654 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC3P51654 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC3P51654 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC3P51654 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC3P51654 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GPC3P51654 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms