Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
BMI1P35226 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 PERP-201ENST00000421351 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 FLNA-202ENST00000360319 8281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 GAB2-201ENST00000340149 6052 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 CPT1C-204ENST00000405931 2785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 AL033529.1-201ENST00000480336 3447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 LIN54-201ENST00000340417 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 MIER2-201ENST00000264819 6884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 ADNP-203ENST00000396029 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 AC010969.2-201ENST00000602458 3231 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 PNPLA8-206ENST00000436062 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 ABCB9-201ENST00000280560 3517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 FN1-206ENST00000359671 8524 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
BMI1P35226 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
BMI1P35226 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
BMI1P35226 RP1-207ENST00000637698 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
BMI1P35226 BCORL1-205ENST00000540052 7127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
BMI1P35226 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
BMI1P35226 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
BMI1P35226 DLGAP2-214ENST00000612087 10088 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
BMI1P35226 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
BMI1P35226 FNIP1-205ENST00000615660 6589 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
BMI1P35226 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
BMI1P35226 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
BMI1P35226 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
BMI1P35226 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
BMI1P35226 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
BMI1P35226 SMAD1-215ENST00000515385 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
BMI1P35226 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
BMI1P35226 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
BMI1P35226 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
BMI1P35226 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
BMI1P35226 XIRP1-201ENST00000340369 6460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms