Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP2P32456 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP2P32456 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP2P32456 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP2P32456 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP2P32456 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP2P32456 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP2P32456 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP2P32456 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP2P32456 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP2P32456 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP2P32456 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBP2P32456 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBP2P32456 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBP2P32456 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBP2P32456 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBP2P32456 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBP2P32456 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBP2P32456 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBP2P32456 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBP2P32456 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBP2P32456 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBP2P32456 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBP2P32456 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBP2P32456 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBP2P32456 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBP2P32456 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBP2P32456 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GBP2P32456 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GBP2P32456 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms