Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms