Protein–RNA interactions for Protein: P0C7Q3

FAM58BP, Putative cyclin-related protein FAM58B, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FAM58BPP0C7Q3 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM58BPP0C7Q3 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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