Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ACSL4O60488 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACSL4O60488 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACSL4O60488 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACSL4O60488 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACSL4O60488 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACSL4O60488 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACSL4O60488 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACSL4O60488 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ACSL4O60488 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACSL4O60488 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACSL4O60488 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ACSL4O60488 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACSL4O60488 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACSL4O60488 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ACSL4O60488 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACSL4O60488 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ACSL4O60488 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ACSL4O60488 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ACSL4O60488 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ACSL4O60488 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACSL4O60488 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACSL4O60488 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACSL4O60488 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACSL4O60488 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACSL4O60488 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACSL4O60488 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACSL4O60488 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACSL4O60488 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACSL4O60488 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACSL4O60488 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACSL4O60488 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACSL4O60488 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACSL4O60488 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACSL4O60488 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACSL4O60488 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACSL4O60488 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACSL4O60488 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACSL4O60488 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACSL4O60488 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACSL4O60488 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACSL4O60488 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACSL4O60488 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACSL4O60488 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACSL4O60488 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACSL4O60488 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACSL4O60488 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACSL4O60488 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACSL4O60488 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACSL4O60488 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACSL4O60488 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACSL4O60488 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACSL4O60488 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACSL4O60488 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACSL4O60488 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACSL4O60488 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACSL4O60488 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACSL4O60488 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACSL4O60488 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACSL4O60488 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACSL4O60488 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACSL4O60488 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACSL4O60488 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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