Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COG3Q96JB2 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms