Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC12Q8WUD4 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms