Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 RN7SL134P-201ENST00000579756 303 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PTF1AQ7RTS3 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTF1AQ7RTS3 AC026271.1-201ENST00000447794 1348 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PTF1AQ7RTS3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTF1AQ7RTS3 AADACL4-201ENST00000376221 1575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTF1AQ7RTS3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTF1AQ7RTS3 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTF1AQ7RTS3 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTF1AQ7RTS3 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTF1AQ7RTS3 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTF1AQ7RTS3 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTF1AQ7RTS3 AC023509.3-202ENST00000591834 1609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTF1AQ7RTS3 SLC36A1-211ENST00000616007 1389 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTF1AQ7RTS3 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTF1AQ7RTS3 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTF1AQ7RTS3 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PTF1AQ7RTS3 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PTF1AQ7RTS3 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PTF1AQ7RTS3 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 ANAPC15-203ENST00000502597 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 HYKK-201ENST00000388988 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 CLNK-203ENST00000507719 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 THEG-204ENST00000530711 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 AC078878.2-201ENST00000543451 286 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 AC091691.1-201ENST00000583587 1018 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 AC005332.2-201ENST00000590010 930 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 TRPC5OS-203ENST00000635763 955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 ARRDC5-201ENST00000381781 1638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 SP140L-205ENST00000458341 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 TRMT11-202ENST00000368332 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 LARP4-207ENST00000518561 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 VGLL1-201ENST00000370634 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 SUMO1-202ENST00000392245 1071 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 KDM5C-IT1-201ENST00000412242 755 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 SDCBP2P1-201ENST00000416115 614 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 ACTG1P23-201ENST00000437653 1074 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 AL021391.1-201ENST00000454439 545 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 NMNAT3-212ENST00000511444 873 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 PTPN20-229ENST00000513756 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 IMMP1L-215ENST00000534812 612 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 LINC02352-201ENST00000557928 468 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 AC133555.4-201ENST00000569081 152 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 LINC01996-201ENST00000573270 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 DUX4L33-201ENST00000635217 958 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 SEPT10-208ENST00000437928 1782 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTF1AQ7RTS3 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms