Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
RPS29P62273 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RPS29P62273 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms