Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HADHBP55084 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HADHBP55084 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HADHBP55084 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HADHBP55084 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HADHBP55084 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HADHBP55084 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HADHBP55084 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HADHBP55084 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HADHBP55084 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HADHBP55084 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HADHBP55084 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HADHBP55084 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HADHBP55084 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HADHBP55084 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HADHBP55084 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HADHBP55084 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HADHBP55084 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HADHBP55084 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HADHBP55084 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HADHBP55084 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HADHBP55084 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HADHBP55084 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HADHBP55084 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HADHBP55084 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HADHBP55084 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HADHBP55084 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HADHBP55084 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HADHBP55084 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HADHBP55084 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HADHBP55084 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HADHBP55084 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HADHBP55084 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HADHBP55084 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HADHBP55084 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HADHBP55084 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HADHBP55084 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HADHBP55084 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HADHBP55084 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HADHBP55084 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HADHBP55084 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HADHBP55084 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HADHBP55084 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HADHBP55084 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HADHBP55084 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HADHBP55084 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HADHBP55084 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HADHBP55084 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HADHBP55084 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HADHBP55084 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HADHBP55084 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HADHBP55084 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HADHBP55084 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HADHBP55084 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HADHBP55084 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HADHBP55084 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HADHBP55084 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HADHBP55084 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HADHBP55084 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HADHBP55084 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HADHBP55084 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HADHBP55084 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HADHBP55084 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HADHBP55084 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HADHBP55084 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HADHBP55084 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HADHBP55084 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HADHBP55084 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HADHBP55084 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HADHBP55084 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HADHBP55084 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HADHBP55084 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HADHBP55084 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HADHBP55084 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HADHBP55084 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HADHBP55084 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HADHBP55084 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HADHBP55084 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HADHBP55084 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HADHBP55084 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HADHBP55084 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HADHBP55084 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HADHBP55084 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HADHBP55084 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HADHBP55084 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HADHBP55084 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HADHBP55084 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HADHBP55084 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HADHBP55084 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HADHBP55084 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HADHBP55084 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HADHBP55084 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HADHBP55084 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HADHBP55084 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HADHBP55084 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HADHBP55084 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HADHBP55084 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HADHBP55084 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HADHBP55084 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HADHBP55084 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms