Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC3P51654 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC3P51654 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC3P51654 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC3P51654 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC3P51654 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC3P51654 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC3P51654 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC3P51654 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC3P51654 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC3P51654 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC3P51654 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC3P51654 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC3P51654 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC3P51654 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC3P51654 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC3P51654 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC3P51654 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC3P51654 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC3P51654 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC3P51654 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC3P51654 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC3P51654 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC3P51654 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC3P51654 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC3P51654 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC3P51654 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC3P51654 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC3P51654 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC3P51654 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC3P51654 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC3P51654 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC3P51654 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC3P51654 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC3P51654 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC3P51654 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPC3P51654 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC3P51654 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC3P51654 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC3P51654 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC3P51654 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC3P51654 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC3P51654 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC3P51654 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC3P51654 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC3P51654 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC3P51654 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC3P51654 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC3P51654 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC3P51654 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC3P51654 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC3P51654 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC3P51654 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC3P51654 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC3P51654 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC3P51654 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC3P51654 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC3P51654 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC3P51654 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC3P51654 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC3P51654 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC3P51654 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC3P51654 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC3P51654 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC3P51654 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC3P51654 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC3P51654 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC3P51654 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC3P51654 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC3P51654 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC3P51654 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC3P51654 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC3P51654 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC3P51654 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC3P51654 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC3P51654 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC3P51654 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC3P51654 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC3P51654 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC3P51654 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC3P51654 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC3P51654 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC3P51654 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC3P51654 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC3P51654 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC3P51654 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC3P51654 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC3P51654 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC3P51654 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC3P51654 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC3P51654 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC3P51654 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC3P51654 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC3P51654 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC3P51654 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC3P51654 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC3P51654 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC3P51654 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC3P51654 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPC3P51654 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms