Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RANGAP1P46060 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RANGAP1P46060 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RANGAP1P46060 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RANGAP1P46060 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RANGAP1P46060 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RANGAP1P46060 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RANGAP1P46060 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RANGAP1P46060 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RANGAP1P46060 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RANGAP1P46060 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RANGAP1P46060 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RANGAP1P46060 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RANGAP1P46060 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RANGAP1P46060 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RANGAP1P46060 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RANGAP1P46060 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RANGAP1P46060 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RANGAP1P46060 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RANGAP1P46060 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RANGAP1P46060 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RANGAP1P46060 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RANGAP1P46060 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RANGAP1P46060 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RANGAP1P46060 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms