Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms