Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYP2C9P11712 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms