Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HKR1P10072 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HKR1P10072 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
HKR1P10072 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HKR1P10072 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HKR1P10072 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HKR1P10072 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HKR1P10072 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HKR1P10072 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HKR1P10072 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
HKR1P10072 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HKR1P10072 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HKR1P10072 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HKR1P10072 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HKR1P10072 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HKR1P10072 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HKR1P10072 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HKR1P10072 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HKR1P10072 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HKR1P10072 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
HKR1P10072 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HKR1P10072 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HKR1P10072 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HKR1P10072 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HKR1P10072 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
HKR1P10072 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HKR1P10072 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HKR1P10072 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HKR1P10072 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HKR1P10072 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HKR1P10072 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
HKR1P10072 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HKR1P10072 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HKR1P10072 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HKR1P10072 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HKR1P10072 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HKR1P10072 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HKR1P10072 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HKR1P10072 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HKR1P10072 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HKR1P10072 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HKR1P10072 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HKR1P10072 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HKR1P10072 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HKR1P10072 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HKR1P10072 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HKR1P10072 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HKR1P10072 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
HKR1P10072 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HKR1P10072 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HKR1P10072 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
HKR1P10072 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
HKR1P10072 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HKR1P10072 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HKR1P10072 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HKR1P10072 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HKR1P10072 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HKR1P10072 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
HKR1P10072 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HKR1P10072 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HKR1P10072 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HKR1P10072 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HKR1P10072 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HKR1P10072 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HKR1P10072 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HKR1P10072 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HKR1P10072 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HKR1P10072 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HKR1P10072 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HKR1P10072 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HKR1P10072 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HKR1P10072 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HKR1P10072 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
HKR1P10072 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HKR1P10072 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HKR1P10072 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HKR1P10072 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HKR1P10072 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HKR1P10072 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HKR1P10072 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HKR1P10072 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HKR1P10072 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HKR1P10072 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HKR1P10072 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HKR1P10072 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HKR1P10072 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HKR1P10072 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HKR1P10072 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HKR1P10072 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HKR1P10072 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HKR1P10072 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HKR1P10072 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HKR1P10072 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HKR1P10072 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HKR1P10072 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HKR1P10072 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HKR1P10072 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HKR1P10072 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HKR1P10072 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HKR1P10072 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms