Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM10L2BP0DMW5 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms