Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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C4orf47A7E2U8 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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C4orf47A7E2U8 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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C4orf47A7E2U8 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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C4orf47A7E2U8 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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C4orf47A7E2U8 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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C4orf47A7E2U8 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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C4orf47A7E2U8 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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C4orf47A7E2U8 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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C4orf47A7E2U8 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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C4orf47A7E2U8 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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C4orf47A7E2U8 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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