Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMED7Q9Y3B3 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms