Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTNAP2Q9UHC6 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms