Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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