Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 TIAF1-201ENST00000359450 5337 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 MYO1C-201ENST00000359786 5145 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 KDM7A-201ENST00000397560 9272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 FANCC-202ENST00000375305 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 RAP1GAP2-201ENST00000254695 6661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 SNHG14-212ENST00000549804 7844 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 AR-208ENST00000612452 10676 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RAB9BQ9NP90 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RAB9BQ9NP90 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
RAB9BQ9NP90 UBN1-202ENST00000396658 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RAB9BQ9NP90 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RAB9BQ9NP90 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RAB9BQ9NP90 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RAB9BQ9NP90 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RAB9BQ9NP90 BCL2L11-217ENST00000610735 5120 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RAB9BQ9NP90 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
RAB9BQ9NP90 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RAB9BQ9NP90 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
RAB9BQ9NP90 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RAB9BQ9NP90 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RAB9BQ9NP90 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RAB9BQ9NP90 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RAB9BQ9NP90 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RAB9BQ9NP90 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RAB9BQ9NP90 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RAB9BQ9NP90 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RAB9BQ9NP90 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
RAB9BQ9NP90 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RAB9BQ9NP90 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RAB9BQ9NP90 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.6 ms