Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COG3Q96JB2 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 306.6 ms