Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX4

RSPRY1, RING finger and SPRY domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPRY1Q96DX4 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
RSPRY1Q96DX4 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
RSPRY1Q96DX4 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms