Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC84Q86UT8 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms