Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATG4DQ86TL0 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms