Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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PRAMEF20Q5VT98 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PRAMEF20Q5VT98 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PRAMEF20Q5VT98 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PRAMEF20Q5VT98 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PRAMEF20Q5VT98 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PRAMEF20Q5VT98 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PRAMEF20Q5VT98 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PRAMEF20Q5VT98 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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PRAMEF20Q5VT98 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PRAMEF20Q5VT98 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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PRAMEF20Q5VT98 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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PRAMEF20Q5VT98 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PRAMEF20Q5VT98 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PRAMEF20Q5VT98 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PRAMEF20Q5VT98 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PRAMEF20Q5VT98 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PRAMEF20Q5VT98 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PRAMEF20Q5VT98 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PRAMEF20Q5VT98 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PRAMEF20Q5VT98 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PRAMEF20Q5VT98 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC13□□□□□ -0.33
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PRAMEF20Q5VT98 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PRAMEF20Q5VT98 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PRAMEF20Q5VT98 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PRAMEF20Q5VT98 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
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PRAMEF20Q5VT98 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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PRAMEF20Q5VT98 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PRAMEF20Q5VT98 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PRAMEF20Q5VT98 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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PRAMEF20Q5VT98 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PRAMEF20Q5VT98 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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PRAMEF20Q5VT98 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PRAMEF20Q5VT98 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PRAMEF20Q5VT98 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PRAMEF20Q5VT98 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PRAMEF20Q5VT98 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PRAMEF20Q5VT98 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PRAMEF20Q5VT98 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PRAMEF20Q5VT98 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PRAMEF20Q5VT98 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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