Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LETM2Q2VYF4 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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